Итак, для начала стоит отметить, что данный подход абсолютно не обязателен при установки рядовых модов. Описываемый способ - скорее необходимость. Наиболее распространённый сценарий его использования - это установка OptiFine на чистый Minecraft. И для этого совсем не обязательно устанавливать Forge или пользоваться специальными программами.
Итак, для начала загрузите нужную Вам версию Minecraft с помощью стандартного лаунчера. Затем зайдите в папку "versions" в корне нашей сборки. Скопируйте папку с нужной нам версией (Например: 1.6.2). Скопированную папку переименуйте так, как Вам будет удобнее (Например: 1.6.2-OptiFine). Зайдите в только что переименованную папку и *.jar и *.json аналогично измените их названия. Почти готово. Осталось только открыть файл *.json и изменить значение параметра "id" на название ранее созданной папки.
Откройте файл *.jar с помощью любого архиватора. Удалите папку META-INF и переместите в архив файлы из ранее скаченного мода. Обратите внимание: Такая установка должна выполняться только если это указано автором мода.