Многие моды сборки урезаны или немного изменены, так что не удивляйтесь, если вы не сможете в JEI найти какой-либо предмет.
На сборке есть
Ore Excavation, так что пользуйтесь им и не устанавливайте Tree Capitator или его альтернативы.
Воду и лаву можно добыть с помощью солнечной трубки.
О том, как она работает, а также как функционирует дробящий блок, посмотрите
здесь.
Время можно добыть в обменниках предметов (в правом нижнем углу квестов)